у меня тоже была такая ситуация (ФОП с Чернигова прописался в Козелецком р-не) у гос. регистратора сказали что с этого года им все равно где прописан человек, главное чтоб был адрес по которому с ним можно связаться. А в налоговой сказали что регистрация по данным из реестра физ. особ- предпринимателей. Так что сейчас человек прописан в селе, а на учете в Черниговской налоговой.