А у меня много раз так было:
например цена 100грн, снимают с карты 102грн, и 2грн на бонусный
Возможно в магазинах не правильно делают, но общалась в чате на сайте банка, мне сказали, что все правильно 
Ну за, то время сколько я работала в привате, это было не правильным. Магазин специально так делает, чтобы не терять свои деньги. И раньше когда клиент обращался мы подавали жалобы на такие магазины.
Может что то поменялось, хотя, сама недавно в чикине оплачивала и часть от моего заказа шла мне в бонусы, не помню, но вроде 2%.